肥胖症与糖尿病关系密切。我国14省、市3l万多人的调查表明，糖尿病在正常人群的发病率为0.26％，而超重者的发病率为2.82％，是前者的10倍多。肥胖症者进食量超过机体需要，过多进食刺激胰岛分泌过量胰岛素，出现了高胰岛素血症，由于肥胖症者的细胞对胰岛素不敏感，将进一步促进胰岛素分泌，使胰岛负荷加重，胰岛细胞增生肥大，长期可导致胰岛功能衰竭而发生糖尿病。另外，肥胖常同时伴有高血脂症，常发生脂肪代谢亢进，使游离脂肪酸升高，加重糖代谢紊乱，更易诱发糖尿病。
肥胖是导致高血压发生发展的危险因素。一项对中、老年的调查显示，体质指数小于20者高血压患病率为7.55％，体质指数24—26之间者高血压患病率为20.26％，当体质指数大于28时，患病率达36.89％。肥胖症者脂肪组织大量增加，必须增加血容量和心输出量才能满足机体需要，长期心脏负荷过重使左心室肥厚，血压升高。其次，肥胖者多有高胰岛素血症，胰岛素可促进肾远端小管对钠的再吸收，使钠潴留并引起高血压。另外，肥胖症者的肾上腺皮质功能活跃，皮质醇转换率增加，皮质酮和脱氧皮质酮羟化增强，可使血压升高。因此，肥胖是导致高血压的重要危险因素。
有调查资料显示，体质指数小于20者冠心病患病率4.72％，体质指数24—26者，冠心病患病率9.91％，体质指数大于28者，患病率高达16.51％。肥胖症者多有高甘油三酯血症，可造成动脉粥样硬化。体重超重、体表面积增大、脂肪组织过多、心脏负荷加重(包括心肌内外脂肪沉积引起的心肌负荷加重)等因素可引起心脏缺血缺氧，肥胖症者体力活动减少，冠状动脉侧支循环削弱或不足。以上诸因素均可导致动脉硬化和冠心病。
临床称为肥胖一通气不足综合征，也称低换气综合征。极度肥胖者胸壁和腹壁脂肪过多，呼吸活动受到限制，呼吸浅表，补呼气量减低而致功能残气量降低，使肺处于接近呼气位置，由于潮气量减低，使肺泡通气量减少，换气受限，造成二氧化碳潴留，动脉血氧饱和度下降，病人可出现紫绀。由于长期缺氧，可继发红细胞增多症，同时血液粘度增加，加重了循环阻力，心脏负荷加重，发生肺动脉高压，发展成慢性肺心病。
肥胖可以引起肝脏的脂肪变性，导致肝脏肿大。肥胖病人由于长期高碳水化合物、高脂肪饮食，及存在高胰岛素血症，从而使肝脏合成甘油三酯的速率大大超过了将其转运出肝脏的能力，或引起极低密度脂蛋白运出甘油三酯发生障碍，导致甘油三酯在肝内堆积而发生脂肪肝。
肥胖症者胆囊炎和胆石症的发病率随肥胖程度和年龄增加而增加，与肥胖症患者肝脏和其他组织合成内源性胆固醇增多有关。正常胆汁中胆盐加卵磷酯与胆固醇之比为11：1，若胆固醇比例增加，则胆固醇将析出结晶和沉淀，易融和成胆结石。胆结石对胆囊粘膜有直接刺激作用，易引起继发性细菌感染而形成胆囊炎。
皮肤可有细的淡红色纹，分布在臀外侧、大腿上内侧、上腹部等处。皮肤折皱处易磨损发生皮炎和癣。长期负重可有腰背痛及关节病变。
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