凡肝脏疾病通过临床、实验或其他辅助检查无法明确诊断者，应进行肝脏穿刺或取组织标本进行病理检查以明确诊断。

这些情况包括：1. 慢性肝炎的分级：这是临床进行肝脏穿刺的一个重要的适应症，因为很多乙肝病毒携带者长期肝功能正常，不符合一般的抗病毒治疗的指征，但是持续的HBV-DNA高水平复制，如果进行肝脏穿刺后病理提示肝脏炎症分级在G2，纤维化分级在S1以上，不论肝功能是否正常，都可以开始抗病毒治疗。2. 肝功能检查异常，原因不明者。3. 肝功能检查正常，但症状、体征明显者。4. 不明原因的肝大，门脉高压或黄疸。5.对病毒性肝炎的病因、类型进行诊断，对病情追踪，疗效及预后的判断。6.肝内胆汁淤积的鉴别诊断。7.慢性肝病的鉴别诊断。8.肝内肿瘤的细胞学检查及进行药物治疗。