肝功能损伤只是一种临床表现，并不是一种疾病，有很多种原因都可能引起肝功能损伤，我们要尽量明确造成肝功能损伤的原因才能进一步针对病因进行治疗并评估预后。

肝功能损伤的常见原因包括：病毒性肝炎；酒精性肝炎；非酒精性脂肪性肝炎；药物性肝损害；化学及工业中毒；自身免疫性疾病；胆道疾病所致的胆汁淤积；其它非嗜肝病毒感染：如巨细胞病毒、EB病毒、埃可病毒、柯萨奇病毒、风疹病毒、麻疹病毒等等；细菌感染：如伤寒、菌血症及败血症等；寄生虫感染：如血吸虫病；代谢性疾病：如肝豆状核变性等；肝淤血：如心衰；妊娠、肝硬化、肝癌：包括原发性肝炎和肝转移癌等。