目前全世界公认的丙肝病毒基因型有6种，为Ⅰ/1a，Ⅱ/1b，Ⅲ/2a，Ⅳ/2b，Ⅴ/3a，Ⅵ/3b。我国以Ⅱ/1b，Ⅲ/2a为主，另有少数Ⅰ/1a和Ⅳ/2b型。其中又以1b型为主，约占70%。测定丙肝病毒基因型对丙型肝炎的抗病毒治疗具有非常重要的意义，目前国际的丙肝防治指南中也对丙肝病毒基因型在抗病毒治疗中的重要地位予以明确，即1b型的患者对干扰素治疗的反应没有非1b型患者好，应根据患者的基因型制定个体化的治疗方案，以达到最优化的治疗。