对于丙肝患者而言，利巴韦林一般耐受良好，其最主要的副作用是剂量依赖性溶血性贫血，应用的剂量根据病人的体重，以及病人的血红蛋白水平，必须在治疗过程中监测。此外，有心肺疾病史或明显心脏症状患者，不能忍受血红蛋白水平的突然下降，如果使用利巴韦林，必须谨慎。此外，利巴韦林可致畸，在患者服用利巴韦林及其配伍药物治疗期间和停药后的6个月内都必须避免怀孕。利巴韦林有一个长期的渐增的血清半衰期，由肾脏排泄，因此它在肾脏疾病患者可以导致严重的副作用，尤其是溶血。利巴韦林的剂量必须根据肾功能调整，肌酐清除率小于50毫升/分钟的病人的药物管理应格外小心。利巴韦林不能用血液透析去除。

此外，在利巴韦林有关的临床试验中观察到的一般全身不良反应有：头痛、疲倦、乏力、胸痛、发热、寒战、流感症状等。消化系统症状有食欲减退，胃部不适、恶心呕吐、轻度腹泻、便秘等；肌肉骨骼系统症状有肌肉痛、关节痛；神经精神系统有眩晕、失眠、易激惹、抑郁、注意力障碍等；呼吸系统症状有呼吸困难、鼻炎等；皮肤附件系统出现脱发、皮疹、瘙痒等；另还观察到味觉异常、听力异常表现。