研究生教育是北医三院泌尿外科重点教学内容。由一名教学骨干医师负责研究生的具体管理工作。截至2010年底，我科已经培养临床型医学博士10名，临床型医学硕士21名，科研型医学硕士4名。现有在读临床型博士研究生10名，科研型博士研究生4名，临床型硕士研究生16名，科研型硕士研究生6名。研究生定期读书报告、理论授课，按时完成研究生中期考核、开题、预答辩。

我科研究生培养教学工作特色包括：

1. 研究生定期与导师沟通座谈。马潞林主任每周二、周四早晨7：10带领八年制研究生查房和专题讨论。对临床型硕士研究生要求其深入临床，委派副主任医师或高年主治医师带领其查房、手术、出门诊。

2. 培养研究生综合能力。坚持每周四早晨7:30至8:00半小时的英语读书报告及讨论会。每周二早晨7：30至8：00全科疑难病例讨论和阅片。每周五专题报告。全科医师轮流报告。每周三晚6至8点，英语口语培训课。

3. 临床型研究生的科研能力培养，主要要求其掌握检索和阅读文献，撰写综述，临床病例总结与分析和论文书写的能力。有部分研究生做与临床结合基础试验。科研型研究生，在完成课题学习后，早定题，依托中心实验室或中科院实验室完成课题。与中科院化学所建立合作研究课题。

4. 研究生临床水平明显提高，研究生毕业时部分研究生可达到低年主治医师水平。目前研究生课题大多数均能在核心期刊发表论文。