内科治疗主要指非手术治疗。首先，病人应了解强直性脊柱炎的相关知识，以积极主动的心态进行治疗。其次是在医生的指导下，选择合适的非甾类抗炎药，以减轻炎症、缓解疼痛和强直，如服药后出现较严重的副作用，可用扑热息痛（如百服宁等）来达到止痛作用。另外，处于疾病早期、尤其是有外周关节炎的病人可选用改变病程的抗风湿药物柳氮磺胺吡啶，是否应用甲氨蝶呤尚存在有争议。晚期病人尤其是那些脊柱已发生竹节样变，又无外周关节炎表现的患者，不再应用改变病程的抗风湿药物，而主要应注重积极的功能锻炼和理疗。