1958年建科伊始，开设3个亚专业门诊，脑血管病，头痛与癫痫，多发性硬化专业门诊。经过60年的发展积淀，学科体系逐渐精细化，系统化，目前设置11个亚专业，各个亚专业各具特色，在国内神经病学领域拥有自己的学术地位，发挥着重要作用。

目前神经内科共分为11个亚专科： 1、运动神经元病专业组；2、脑血管病专业组；3、神经电生理专业组；4、认知功能障碍与痴呆专业组；5、神经肌肉病理组；6、头痛、神经病理性疼痛专业组；7、神经免疫专业组；8、癫痫与睡眠障碍专业组；9、帕金森病及运动障碍疾病专业组；10、神经重症专业组；11、神经遗传病专业组。