北京大学第三医院（以下简称北医三院）泌尿外科成立于1958年。经过杨文质教授、陈忠新教授、马潞林教授、张树栋教授历任科主任的不懈努力，已发展成为集临床、科研、教学于一体的国内外享有盛誉的大型泌尿外科诊疗中心。现北医三院泌尿外科为卫健委国家临床重点建设专科、内镜诊疗技术培训基地、教育部国家重点学科、北医三院重点建设学科、北京大学外科学博士学位授予单位。目前在编医师44人，博士生导师7名，博士后合作导师4名，硕士生导师9名，近5年科室获国家自然科学基金委优秀青年科学基金资助项目、华夏青年医学科技奖、北京市科技进步二等奖、北京市医学科技二等奖、世界华人泌尿学会新星奖、北京市优秀医师奖、北京大学“临床科学家”、北京大学优秀青年医师奖等。病房下设三个病区，标准住院床位共99张，年门诊量20余万人次，年住院手术量5000余台，其中机器人辅助腹腔镜手术量近千台。学科覆盖面广，分为肿瘤组（肾癌、前列腺癌、膀胱癌、上尿路尿路上皮癌、肾上腺肿瘤、腹膜后肿瘤等亚专业组）、结石组、肾移植组、男科组、尿控组等，综合医疗实力雄厚。

北医三院泌尿外科实验室为医院重点实验室，承担多项基础研究和转化研究。近5年来，承担国家自然科学基金重点、优青及面青项目、科技部重点研发计划、科技部支撑计划等国家级项目20余项；北京市自然科学基金重点及面青项目、北京市科委、卫健委等省部级项目20余项；学（协）会、校院级项目及课题70余项，到账经费3000余万元。学科获2023年中国最佳临床学科评估排行榜第6位，2021年度复旦大学泌尿外科专科综合排行榜第10位，2019、2020年中国医院泌尿外科互联网影响力排行榜第1位，北京市DRGs专科综合评价排名第1位。