2024年10月14日-15日,北京大学第三医院医学创新研究院基础医学研究中心联合QIAGEN公司,面向全院成功举办2024年CLC、IPA组学生信分析培训班。
CLC覆盖的分析功能
CLC GxWB 是一款综合性生物信息学分析工具,可提供针对不同应用的数据分析工具和模块,分析对象包括二代和三代测序数据拼接、转录组差异基因分析、重测序变异检测、单细胞转录组测序数据分析、单细胞TCR 测序数据分析、甲基化测序数据分析、ChIP-seq数据分析、微生物宏基因组数据分析、微生物扩增子数据分析、病原微生物分型等。
基于IPA构建分子调控网络的示意图
QIAGEN IngenuityPathway Analysis (IPA®)是一款基于人工阅读文献并整理成相关线索,构建成基因-蛋白-疾病表型等多维度的立体网络,提供强大的知识检索功能和数据分析能力。通过图形化可视界面的访问,大大降低了对生物信息学编程能力的要求。通过表型与基因型的关系快速确定疾病致病机制,并辅助临床诊断和科学研究。
为了提高培训效果,培训前期基础医学研究中心生信平台与QIAGEN公司积极沟通,为全部学员开通CLC、IPA两个生物信息分析软件为期14天的试用账号。
10月14日上午,QIAGEN公司陈斌博士分别对CLC基因分析、转录组分析、单细胞转录组分析、宏基因组分析进行讲解,下午进行软件安装和实操培训。10月15日,分别对IPA查询功能、上传与分析数据、组学结果解读进行授课;下午进行IPA软件安装及实操培训。
培训现场
两天来,北医三院妇产科、运动医学科、骨科、心脏外科等24个科室的59名师生参加了此次培训。授课结束后学员们与授课教师针对数据分析进行了积极的讨论与充分交流。参加培训的研究生、博士和临床医生们,纷纷表达了对此次数据分析培训班的肯定,并表示CLC和IPA分析软件对课题数据有很好支撑作用,希望我院基础平台能尽快引进该数据分析工具。
北医三院医学创新研究院基础医学研究中心将继续推进生信培训和平台软件的引进,并致力于向全院师生提供课题咨询、MDT多学科讨论、仪器培训和预实验支撑等模式的全链条科研服务。