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检验科开展病原宏基因组测序检测项目的通知

发布时间:2022-12-10    点击数:

检验科将开展病原宏基因组测序(mNGS)检测项目外送项目,病原宏基因组(mNGS)是一种新的不依赖传统微生物培养而广泛分析临床标本中微生物组(细菌,真菌,病毒,寄生虫)的高通量测序方法。该技术通过高通量测序和智能化算法分析,可以获得疑似致病微生物的种属信息,无偏向性鉴定细菌、真菌、病毒和寄生虫等多种病原微生物。适用于不明原因发热、疑难危重以及免疫缺陷等特殊感染患者。

一、项目名称及收费

序号

项目名称

收费名称

计价单位

计价次数

费用

1

病原宏基因组检测(DNA)

肿瘤组织脱氧核糖核酸(DNA)测序

1

3800元

2

病原宏基因组检测(DNA+RNA)

备注:从卫生经济学考虑,建议仅在临床不除外RNA病毒感染时加开此医嘱。如呼吸道RNA病毒感染(流感病毒、副流感病毒、鼻病毒、呼吸道合胞病毒、冠状病毒等)、中枢神经系统RNA病毒感染(乙型脑炎病毒、柯萨奇病毒、ECHO病毒、狂犬病毒等)、血液RNA病毒感染(登革病毒、汉坦病毒等)以及其他标本中的RNA病毒感染等。

肿瘤组织脱氧核糖核酸(DNA)测序

1

5780元

病原体核糖核酸扩增定性检测

18

二、标本采集

标本类型

标本量

采集耗材

注意事项

鼻咽拭子

1根拭子

拭子

采集完成后应立即置于病毒运输培养液中。

支气管肺泡灌洗液(BALF)

≥5ml

无菌瓶

弃去前段可能污染的部分,建议第二管肺泡灌洗液

气管/支气管吸取物

≥5ml

下呼吸道痰(脓痰)

≥3ml

如无法采集BALF或气管支气管吸取物才考虑下呼吸道痰。用清水或生理盐水漱口,用力咳嗽咳出深部痰。

血液

成人3-5 mL,

儿童≥1.5 mL

专用采血管Gene seek管

尽可能在使用抗菌药物治疗前采集标本;如患者已经使用抗菌药物治疗,应在下一次用药之前采集。

寒战或发热高峰前30-60分钟内采血。

考虑感染性心内膜炎患者应在使用抗菌药物前30分钟内采血。

脑脊液

≥1.5ml

无菌瓶/无菌管

细菌性脑膜炎:应立即采集脑脊液,在使用抗菌药物前采集。

分枝杆菌、隐球菌或慢性脑膜炎:建议多次取样送检。

建议采集第二管脑脊液送检

关节液

≥5ml

尽可能在抗菌药物使用前采集

尿液

≥20ml

仅在常规检验无法诊断,考虑特殊感染或重症感染时建议送检mNGS,收集中段尿或耻骨上穿刺尿。

组织

手术组织≥1cm3

活检组织(1.0~2.0)cm×0.1 cm。

骨关节:4-5块不同部位组织,总量0.5-2g

腹水

穿刺液≥10ml,引流液≥5ml

无菌瓶/无菌管

尽可能在抗菌药物使用前采集

胸水

皮肤软组织

组织≥1cm3

脓肿抽取物尽量采集

无菌瓶/拭子

(1)闭合性脓肿:消毒皮肤后抽取脓液。

(2)开放性脓肿:去除表面分泌物,采集病灶的基底部或脓肿壁取其病变进展边缘的标本。

(3)脓疱或水疱:消毒皮肤,挑破脓疱拭子采集脓液,或抽取脓液。

(4)蜂窝织炎:抽吸采样或组织活检。

(5)伤口标本:从边缘采集活检标本

(6)烧伤伤口:彻底清洁创面,采集病损边缘组织,如有液体渗出时用拭子用力擦拭取样,避免采集表面标本。

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